Entenda o impacto da água em suas técnicas analíticas.

PURELAB®

Ultrapure water for genomics and genetics research

Descubra qual a importância da água para a Espectrometria de massa, Biologia Molecular e HPLC

Espectrometria de massa

A espectrometria de massa é uma técnica altamente sensível que permite a análise de traços de misturas complexas e, portanto, requer água de altapureza

Espectrometria de Massa Acoplada a Plasma Indutivo (ICP-MS)
Os avanços na instrumentação analítica moderna continuaram a melhorar a sensibilidade da análise de traços de metal, ao ponto de os elementos serem agora medidos em níveis de ppt e sub-ppt. A espectrometria de massa acoplada a plasma indutivo (ICP-MS) é capaz de detetar vestígios de metais até níveis de ppq (partes por quadrilhão). Isto é feito através da ionização da amostra e, depois, usando espectrometria de massa para separar e medir os íons. Como resultado dos requisitos de sensibilidade muito elevados, recomenda-se o Tipo I/I+ para garantir níveis de pureza.

Cromatografia Gasosa - Espectrometria de Massa (GC-MS)
Combinando cromatografia a gás com espectrometria de massa, a cromatografia gasosa - espectrometria de massa (GC-MS) é usada para identificar diferentes substâncias e tem uma ampla variedade de aplicações, tais como deteção de drogas e análise ambiental. Purga e retenção GC-MS é a técnica de eleição para determinar EDCs e VOCs no ambiente. A exigência de pureza da água é extremamente rigorosa, uma vez que são necessários níveis muito baixos de TOC. Com base nisso, a água Tipo I é adequada para esta técnica.

Cromatografia Líquida - Espectrometria de Massa (LC-MS)

Uma técnica altamente versátil, Cromatografia Líquida - Espectrometria de Massa (LC-MS) combina a separação física da cromatografia líquida e as 

 

capacidades de análise da espectrometria de massa. As amostras são separadas antes de serem detetadas e identificadas, o que gera muitos potenciais de aplicação diferentes. Podem ser analisados mais analitos com esta técnica do que com a GC-MS. A água Tipo I é geralmente recomendada para esta aplicação.


Impacto da água

Todos os pré-tratamentos da amostra, tais como a extração em fase sólida e preparação da amostra, requerem água ultrapura Tipo I com 18,2 MΩ .cm de resistividade e TOC extremamente baixo. Caso se depare com alguns dos seguintes problemas, verifique a qualidade da sua água!

• Picos de adução 
• Dados de baixa qualidade: mudança dos tempos de retenção, perda de resolução, picos de resíduos, desvio da linha de base, ruído na linha de base, picos negativos, picos fantasma
• Contrapressão: colunas explosivas, coluna com vida útil mais curta, desligamento do sistema






Biologia Molecular 

Biologia Molecular é o estudo da composição, estrutura e interações de moléculas celulares – como ácidos nucleicos e proteínas. A ciência dos genes é focada no estudo da variação genética e da hereditariedade nos organismos. A Histologia é o estudo da anatomia microscópica de células e tecidos.A biologia molecular é o estudo da composição, estrutura e interações de moléculas celulares, como ácidos nucleicos e proteínas.

Como funciona a Biologia Molecular?
A biologia molecular trata da compreensão das interações entre os vários sistemas de uma célula, particularmente a relação entre DNA, RNA e síntese de proteínas, e a regulação dessas interações. Ele se sobrepõe significativamente a outras ciências biológicas, em especial genética e bioquímica.
Os biólogos moleculares usam uma variedade de técnicas para estudar ácidos nucléicos e proteínas, incluindo reação em cadeia da polimerase (PCR), sequenciamento de DNA e RNA, microarranjos de DNA e eletroforese de ácidos nucléicos. O PCR é uma técnica usada para amplificar um pedaço de DNA, gerando milhares a milhões de cópias de uma sequência específica de DNA em poucas horas. O sequenciamento de DNA é a determinação da ordem dos nucleotídeos em uma fita de DNA, enquanto o sequenciamento de RNA examina a quantidade e sequências de RNA em uma amostra para analisar padrões de expressão gênica e transcriptômica. Microarranjos de DNA são uma coleção de sequências de genes imobilizadas em um suporte sólido, como vidro, um chip de silício ou esferas microscópicas. Essas matrizes permitem que os biólogos moleculares meçam a expressão de dezenas de milhares de genes simultaneamente e genotipem várias regiões de um genoma. A eletroforese de ácido nucleico é uma maneira de separar DNA, RNA e proteínas com base no tamanho e na carga elétrica.

 Para que serve a Biologia Molecular?

As técnicas de biologia molecular podem ser aplicadas em muitos campos, incluindo pesquisa, diagnóstico médico, forense e agricultura. Os pesquisadores usam métodos de biologia molecular para estudar a estrutura e a função dos genes, e realizam estudos epigenéticos para prever mutações, genes individuais e interações genéticas que podem afetar a expressão de um fenótipo. O diagnóstico médico emprega técnicas de biologia molecular para aplicações como testes genéticos e de doenças infecciosas, detecção de mutações oncogênicas e até histologia, por exemplo, para rastrear câncer de mama HER2 positivo. A biologia molecular também contribuiu para o desenvolvimento de terapias gênicas e desempenha um papel importante na compreensão da fisiologia celular, permitindo que o método de ação e regulação seja investigado e usado para direcionar com mais eficiência o desenvolvimento de medicamentos e aprimorar os testes diagnósticos. Cientistas forenses confiam na amplificação por PCR do gDNA para diferenciar entre indivíduos para fins de identificação, enquanto na agricultura o PCR desempenha um papel fundamental na detecção de patógenos alimentares, genotipagem de plantas e testes para organismos geneticamente modificados

 Qual é o impacto da água na biologia molecular?

A qualidade da água tem um efeito tremendo nas técnicas de biologia molecular. Em aplicações genéticas, é essencial usar água altamente pura com níveis de nuclease abaixo do limite de detecção ao preparar tampões, reagentes e em todo o fluxo de trabalho – por exemplo, ao operar o sequenciador de DNA – para evitar a degradação de ácidos nucleicos. A mesma água de alta pureza também deve ser usada durante a fabricação de microarranjos de DNA.

Que tipos de contaminantes na água podem afetar os resultados da biologia molecular?
Embora as nucleases sejam o principal contaminante para todas as técnicas discutidas, os métodos de biologia molecular também são afetados por íons, compostos orgânicos e bactérias.

 Nucleases - Água altamente pura com níveis de nuclease abaixo do limite de detecção é essencial para evitar a degradação do DNA/RNA durante o PCR, sequenciamento, eletroforese, preparação e uso de microarranjos.


Íons - O PCR usa polimerase, que requer uma concentração específica de magnésio para máxima eficiência e é sensível a metais pesados, como cádmio e zinco, bem como a vários metais bivalentes. É particularmente afetado por metais de transição – por exemplo, ferro, cobalto, cobre e níquel – que podem se ligar ao sítio ativo da enzima e afetar sua atividade catalítica. Na eletroforese, concentrações desconhecidas de íons tornam mais difícil manter a força iônica necessária e o pH dos tampões. Concentrações de íons desconhecidas também são um problema com microarranjos, onde são necessárias concentrações específicas para a hibridização ideal.


Compostos Orgânicos - No PCR, moléculas orgânicas carregadas negativamente mimetizam a carga do DNA e podem interferir no processo catalítico atuando como inibidores não competitivos, reduzindo a eficiência da polimerase. Os compostos orgânicos também são contaminantes disruptivos no sequenciamento de DNA e podem afetar adversamente a eletroforese em gel, com grandes ácidos orgânicos – por exemplo, ácidos húmicos e fúlvicos decorrentes da degradação da matéria natural – co-eluindo com os fragmentos de DNA. Compostos orgânicos também podem dar origem a erros de sequenciamento, absorvendo e extinguindo o sinal dos corantes fluorescentes frequentemente usados ​​para detecção, e interferir no processo de hibridização de microarranjo.
 
Bactérias - As bactérias podem liberar nucleases na água e devem ser reduzidas a um nível tão baixo quanto possível para evitar a degradação do nucleico.


Como a ELGA resolve problemas de pureza da água para biologia moleular?
A experiência e a reputação de longa data da ELGA garantem que sua equipe experiente possa ajudar os clientes a determinar o nível de pureza da água necessário para suas aplicações. A empresa oferece uma variedade de sistemas de purificação de água para aplicações de biologia molecular, cada um com suas próprias vantagens e limitações. Por exemplo, o PURELAB Chorus 1 Life Science, sustentado pelo avançado sistema de deionização PureSure®, fornece consistentemente pureza de água de 18,2 MΩ.cm (Tipo I+/I), com contaminação orgânica e bacteriana muito baixa e nucleases abaixo do limite de detecção.


Cromatografia Líquida de Alta Performance (HPLC)

A cromatografia líquida de alta pressão, agora conhecida como cromatografia líquida de alta resolução (HPLC), é uma técnica cromatográfica utilizada para identificar, quantificar, separar e purificar compostos individuais presentes numa mistura.

Como funciona a cromatografia líquida de alto desempenho?

Na cromatografia líquida de alto desempenho (HPLC), a mistura da amostra é passada, juntamente com um solvente líquido sob alta pressão, através de uma coluna preenchida com um material adsorvente sólido. A pressão dentro do sistema é obtida com a ajuda de bombas. O princípio de funcionamento é que cada composto na mistura interage de modo ligeiramente diferente com o material adsorvente na coluna, do qual resultam taxas de fluxo variáveis para os diferentes componentes. Isto leva à separação dos componentes à medida que fluem para fora da coluna. O material adsorvente utilizado é tipicamente granular, constituído por partículas sólidas, tais como sílica, constituindo a "fase estacionária". O líquido pressurizado é uma mistura de solventes, tais como água, e líquidos orgânicos, tais como metanol e acetonitrila, que constituem a "fase móvel". O detetor é ligado a um microprocessador digital e software de utilizador para aquisição e análise de dados. Os compostos separados são visualizados como picos, sendo o número de picos correspondente ao número de componentes separados na mistura. A área do pico é proporcional à concentração do composto presente na mistura. A resolução entre dois picos nas técnicas cromatográficas é a dimensão até à qual as substâncias são separadas durante a experiência. Maior resolução reflete uma boa separação dos compostos.

Para o que é utilizada a cromatografia líquida de alta resolução?

A cromatografia líquida de alto desempenho tem uma ampla variedade de aplicações nas áreas da bioquímica, química analítica, farmacêutica, forense, pesquisa de alimentos e outras. Por exemplo, a HPLC também é utilizada no ensaio de substâncias proibidas em atletas.

Por que usaria cromatografia líquida de alto desempenho?

A HPLC é acessível e adaptável. Proporciona benefícios úteis, tais como a gestão de dados e a validação de instrumentos.

Quais são os diferentes tipos de contaminantes na água que afetam os resultados da HPLC?

1. Orgânicos - A contaminação orgânica da água ultrapura pode afetar a separação cromatográfica de diferentes maneiras:
(i) Redução da vida da coluna - Moléculas orgânicas que se ligam à superfície da coluna podem retardar o acesso de moléculas da amostra e solvente aos sítios de ligação dentro dos grânulos da coluna (fase estacionária). Daí resulta uma diminuição na capacidade da coluna de separar compostos ou perda de resolução e uma vida útil mais curta da coluna.
(ii) Sensibilidade reduzida - Moléculas orgânicas na água eluente podem competir com moléculas da amostra para ligação aos grânulos da coluna (fase estacionária). Isto diminui o número de moléculas da amostra que se ligam à coluna, reduzindo como consequência o número de moléculas libertadas durante o processo de eluição.
(iii) Dados imprecisos - Picos contaminantes ou fantasma podem ser obtidos a partir de produtos orgânicos que podem acumular-se no topo da coluna e, posteriormente, ser recolhidos como eluato.
(iv) Mudança no tempo de retenção - Altos níveis de orgânicos podem criar uma nova fase estacionária na coluna, o que pode causar uma mudança no tempo de retenção e nos resíduos do pico. Também pode levar a um aumento da contrapressão.


É, portanto, fundamental monitorizar com precisão o nível de orgânicos na água usada para aplicações de HPLC. O carbono orgânico total (TOC) mede as espécies orgânicas totais presentes na água. O TOC é medido em unidades de partes por milhão (ppm) ou partes por bilhão (ppb). Os orgânicos, presentes em ppb elevado, podem alterar a identificação espectral de componentes vestigiais dentro da mistura e influenciar a quantificação do pico.
Um sistema de HPLC pode ser contaminado por uma grande variedade de fontes de TOC. Estas incluem água, lixiviação de meios de purificação, tubos e recipientes, contaminação bacteriana e, potencialmente, absorção da atmosfera. Na verdade, recomenda-se agora evitar o uso de água engarrafada de alta pureza, que não seja acabada de purificar. Isto deve-se ao facto de a água engarrafada por HPLC, que se encontra num ambiente de laboratório há mais de 8 h (exposição a produtos orgânicos atmosféricos) ou água destilada, ser suscetível a um aumento dos níveis de TOC.


3. Íons - A presença de íons no solvente também pode afetar separações cromatográficas. A presença de quaisquer íons absorventes de UV, tais como nitratos, nitritos, sulfatos, brometos, cloretos e fluoretos, pode passar através da coluna e aparecer como um pico no cromatograma, dificultando a leitura dos dados.
Entre os diferentes contaminantes da água que afetam a análise por HPLC, os orgânicos são de longe os determinantes mais importantes para a pureza da água. Evidências experimentais sugerem fortemente que a água ultrapura acabada de preparar deve ser a escolha para qualquer HPLC, pois outras fontes de água, nomeadamente água destilada ou mesmo água engarrafada de grau HPLC, contêm ainda quantidades relativamente altas de orgânicos, o que pode comprometer a qualidade dos cromatogramas e o desempenho do aparelho. 


Por conseguinte, é imperativo garantir a utilização de sistemas de purificação de água de alto padrão e a manutenção adequada do próprio sistema.

Como é que a ELGA Veolia resolve os problemas de pureza da água para HPLC?

Existem diferentes sistemas de purificação atualmente disponíveis, tendo cada método o seu próprio conjunto de vantagens e limitações. A experiência da ELGA em sistemas de purificação de água tem uma reputação de longa data. A ELGA classificou a pureza da água em diferentes graus, o que pode ajudar a determinar o nível de pureza da água necessário para uma determinada aplicação. Por exemplo, o nosso sistema de pesquisa analítica PURELAB ® Chorus 1fornece água ultrapura tipo I com níveis de TOC tão baixos como 2 ppb, o que é extremamente adequado para experiências de HPLC. A ELGA fornece sistemas de purificação de água fáceis de usar, de baixo custo e de baixa manutenção.

 

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